我要吐槽一下上海摆谱生物的DIA蛋白测序问题
蛋白测序哪家强蛋白测序哪家强。
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蛋白测序哪家强——我不知道,
但是这个上海摆谱生物,我的感觉是,他们不行。
没有一丁点儿偏见。
背景及过程:
1. 该公司销售人员来到我们单位,说是他们蛋白DIA测序多么多么好,精度多么高;
价格,这就不说了,多少照顾一下他们的顾虑;
2. 2024年12月上旬送了4个样本,倒也不多(微生物培养物上清);
3. 一个月左右跟我反馈说是上清中蛋白含量太低,SDS-PAGE看不清条带【送样前我是检测过的,SDS-PAGE条带没有问题的——至少我感兴趣的目标条带还是肉眼清晰可见的】;
4. 于是, 送了第二次样品,还做了浓缩(用的是超滤管,5 Kda的;4℃离心——结束之后SDS-PAGE验证),大概就是8 mL浓缩到了0.5-1 mL的体量吧,浓缩的程度虽然不是太高,但是目标条带在SDS-PAGE胶上面是很清晰了;
5. 又是一个月,什么东西没测出来,说什么搜库没有得到序列。。。。。。
你搜库没有得到对应的序列,那你测序总会得到及条序列的吧??什么也没有;
这不等于什么都没测到吗???
6. 于是销售跟我说,跟公司的同时联系过了,不行让我送胶条试试;
我就将样品重新制备——浓缩——跑SDS-PAGE,切胶(我感兴趣的条带)——送样。
7. 差不多又是一个月吧,现在是3约下旬了,给我反馈回来了两个样本的测序结果;另外两个说法仍然是搜库没有得到结果。
我心想,好歹出来了两个吧,不是吗!!
今天早上详细看了下结果,如下:
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蛋白鉴定表中,只提供了一些简单的疑似肽段,一个完整的蛋白序列都没有。。。。。
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肽段鉴定表,这就是垃圾啊不是吗?我要测序,DIA蛋白测序,你给我这些疑似的肽段序列有什么用?????
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肽普匹配表,这有意思吗???
我的protein sequence在哪里??
这是给我的胶条做的DIA测序,连一条蛋白序列都没测出来,我要这样的结果有什么用?
我要的结果,蛋白序列——你至少每个胶条样本,给我一条我感兴趣的靶标蛋白序列也行啊,愣是一个没有!!!
这样的垃圾数据,一堆一堆的,我要它何用??你让我如何能够接受???!!!
上海摆谱生物,你们谁能出来给我解释一下行不行?
连一个有用的结果都没有,前前后后送样3次,4个月的时间啊。。。。。。。
蛋白测序哪家强——我不知道,
但是这个上海摆谱生物,他们不行。
没有一丁点儿偏见。
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